朱載坖對於李春芳的這些建議，還是比較讚同的，畢竟現在吏員的數量是十分龐大的，如果驟然實行吏員考選入官的話，會有一大批的吏員進入官僚隊伍當中，這會直接衝擊現在大明的官僚體係的，這是朱載坖所不能接受的。
說白了，這就是改革的核心目的問題，在朱載坖看來，改革的主要目的是什麼？是要加強朝廷對於地方的控製，盡可能的減少地方士紳把持縣政的可能性，至於給吏員以晉升通道，隻不過是為了達成目標的手段罷了。
朱載坖不能因此而影響朝廷官僚隊伍的穩定，畢竟朱載坖主要依靠的還是以進士、舉人為主的科舉出身的官員，朱載坖不可能不考慮他們的感受，所以對於朱載坖來說，吏員升遷入官，主要是刺激吏員們成為幹活的工具，朱載坖自己也很清楚，現在大明官員的主要出身是科舉正途，這點是不會改變。
而且對於吏員，官員們都是報以一種鄙夷的態度，認為吏員們貪贓枉法，殘虐害民，這點確實是不假，尤其是那些捐納而來的吏員，楊博就說道：“吏典承差人等納米納草，多出假貸，及既得官給俸，而又斂民以償之。”
他們向朝廷繳納錢糧，買到吏員身份，在他們看來是自己的投資，既然是投資，那就要收迴成本，對於他們來說自己既然是向朝廷繳納了錢糧，那麼上任之後，自然是要迴本的，而指望朝廷的工食銀，顯然是不足以迴本，他們主要是向百姓盤剝，來收迴自己捐納的成本。
所以朱載坖認為讓大量吏員進入官僚隊伍也並非好事，他們可能會將吏員中的一些壞習氣帶入官場之中，這就不是朱載坖所需要的了。
李春芳還提出了一個問題，衙門中除了這些文職吏員之外，還有大量的捕役，也就是百姓所稱的捕快，他們也是地方衙門中的一個重要組成部分，文職吏員們可以通過考選晉升為官，但是衙門中所管三班差役呢？如捕役等，是不是也要給他們一個出路。
捕役們大多學識很低，要是考選的話，恐怕他們是很難過關的，但是作為大明的基層國家暴力機器，也不能不重視。
對於這個問題，朱載坖和大臣們也確實是開始思考此事，這其實是他們在官僚係統中的一個製度缺失，本來在縣一級，之前都是設有縣尉的，與縣丞同為縣令佐官，掌治安捕盜之事。 一般大縣二人，小縣一人。但是大明廢除了縣尉，也就導致了大明在縣一級沒有專門的巡捕官來維持治安，打擊犯罪。
而在現在的大明，縣級主要是由主簿負責巡捕之事，但並非明確官職，隻是一種職務兼領，實際上也大體如此。因為大明巡捕官並不存在於官僚的體係中，沒有品級和額設，但是它又有法定的職掌，需要履行一定的職權。雖然大明不設縣尉，但是縣尉的職掌還是要有人來履行的。
朱載坖認為這是一個製度缺失，因為三班衙役的晉升，就應該就是以巡檢和縣尉作為主要的方向，而且捕役在基層縣衙之中的數量也是非常之多的，這點也必須重視。
現在看來，吏員製度的改革，牽涉的麵是非常之廣的，這事是急不得，朱載坖問道：“此事要擇一重臣加以專理，卿等以為，何人可以擔此重任？”
朱載坖本來屬意的人選是高拱，因為高拱有魄力，而且和楊博等人關係好，是朱載坖心目中推動改革的合適人選，但是李春芳主動請纓，要求由自己來負責此事，李春芳一堂堂首輔之尊，向朱載坖請命，朱載坖當然是要答應的，於是朱載坖指令內閣首輔李春芳負責吏員改革的相關問題，吏部、戶部加以配合。
李春芳領命之後，首先就是開始調查，以京師六部各衙門的小吏和北直隸的小吏為主，調查這些吏員的年齡，進入衙門的時間，以何種方式進入的等。
在得到了調查數據之後，李春芳召集內閣成員，和吏部尚書楊博，向各位重臣陳述了調查得來的情況，京師衙門的吏員，捐納的較少，主要是子承父業的多，也有部分是僉充而來，總的來說京師吏員的素質相對較高，而地方州縣的吏員，主要就是捐納和子承父業而來的。
京師吏員還有相當部分的人有監生、秀才的功名，但是地方州縣衙門的吏員，有功名的就很少了。對於這種情況，李春芳認為也正常，之前大開捐納，大量的吏職得以捐納，部分沒有捐納吏員的仕途又由於受到捐納者的擠壓，升遷更為艱難，在地方衙門中，吏員升遷，基本上全看銀子，法紀蕩然，
對於這些情況，內閣和吏部早就有所知情，畢竟連官員的升遷都不能保證沒有利益因素，更何況這些吏員呢？
李春芳認為，首先要做的就是應該規範吏員的來源，李春芳向朱載坖上了請永禁捐納吏職疏，請求朱載坖下詔禁止捐納吏員，此事得到的朱載坖的同意，朱載坖下詔，永禁捐納吏職，禁止通過捐納的形式取得吏職。
接下來李春芳向朱載坖上了第二疏，請令流外吏職等級疏，李春芳在奏疏中認為，應當和流內官員一樣，在流外吏職設置等級，使得吏員們也能夠按照等級，以年資和考績晉升，李春芳將吏員設立為五等十級，從流外一等到流外五等，每等又分上下兩級。
吏員們每年考核，按照考績來決定是升遷還是降級降等，同時李春芳還建議，將各級衙門的各級吏職，統一編訂等級，按照等級，揀選相應的吏員擔任相關職務。
這樣一來，衙門小吏要再想操弄衙門，架空官員都變得不太現實了，畢竟考績是直接掌握在官員手中，隻要官員們願意，隨時可以通過考績將這些吏員們罷黜、調離現職，甚至直接罷黜吏員身份。