拿到了第一枚徽章後，小智一行人快速前往武鬥道館，等待駛往武鬥島的船出發的期間，一行人決定在卡那茲市分開來自由行動一陣子。
小勝偶然遇到了喜歡小孩的得文製造股份有限公司的社長，茲伏奇，因此小勝跟著他參觀公司，看到了新研發的裝置就是可以窺探寶可夢夢境的機器以及可以與寶可夢講話之類、成為寶可夢的裝置。
......
【小勝：那些裝置也不知道發售了沒？要是真的發售了，那訓練家跟寶可夢之間就能夠暢快交流，很方便！】
【米可利：大吾，叫你呢！】
【大吾：目前還在研製中，還有很多細節需要研究，沒有那麼快出來的。】
大吾全名叫茲伏奇·大吾，是得文公司茲伏奇社長的兒子。
【希巴：快點研製出來就好，即使沒有波導之力跟超能力也能夠跟寶可夢互相交流，從此訓練家跟寶可夢之間沒有交流障礙。】
現在的訓練家跟寶可夢相互交流很多都是互猜的，有時候會理解錯意思，要真有能夠跟寶可夢講話之類的設備，那很大程度會很方便。
.......
白世界——
小勝剛到得文公司的時候就聽到了君莎說這裏疑似有人入侵，發現研究員偷走了得文公司複活化石寶可夢的研究成果，看到冒牌研究員使用了鐵螯龍蝦，小智一行人也從君莎的口中得知了豐緣地區存在海洋隊以及熔巖隊。
豐緣地區也有邪惡組織，不像是關東地區那樣，火箭隊一家獨大。
眾人就在想海洋隊以及熔巖隊又在搞什麼鬼！
因為為小遙的疏忽，所以小智一行人沒有搭上前往武鬥島的聯絡船，而小遙找到了哈奇老人，原本說好可以帶他們到武鬥島的，突然間態度發生了一百八十度的大轉變。
原來逃離得文公司的海洋隊隊員要挾了哈奇老人，抓住了哈奇老人的長翅鷗小皮作為威脅，他們也想要征用哈奇老人的船跟隊友匯合。
火箭隊三人組出來送助攻，他們這次的目標還是到處都能見到的長翅鷗，而在火箭隊三人組製造混亂的過程中，海洋隊隊員則自己搭乘上了船隻逃離，順便再次搶走了小皮。
為了追迴小皮，哈奇老人拿出了自己準備好的第二艘船，追逐了一番，而海洋隊那些家夥跟潛水艇匯合，而小智一行人也來到了武鬥島。
就在武鬥島，藤樹要跑去衝浪 沒有跟小智進行道館對戰。
火箭隊出來搞事情，卻被小智打飛，因此助攻了小智，藤樹改變主意，接受了小智的對戰請求。
？
又是火箭隊三人組的助攻！
一路看過來，火箭隊三人組真的是不知不覺中幫助了小智很多次，雖然本意是捕捉皮卡丘。
可惜小智太輕敵，認為藤樹沉迷於衝浪，實力應該不強。但事實上，藤樹很擅長將衝浪的技術運用在戰鬥上，他的腕力，幕下力士也很強，小智完全不是對手。
至此，小智派出的兩隻寶可夢全都被打敗。
......
【希巴：藤樹還是那麼強，專門寶可夢衝浪，遇到攻擊的時候跟衝浪時遇到大浪身體保持穩定的動作是一樣的。】
【藤樹：險勝而已，後麵小智鍛煉之後就贏了，他是成長型的天才訓練家。】
......
而小智被打敗之後，就在武鬥島進行修煉，途中聽說了大吾來到了石之洞窟，
因為火箭隊三人組挖陷阱的緣故，小智一行人和他們一起掉進了洞穴的最深處 還惹到了可可多拉群，剛好被大吾派出波士可多拉救下，然後將火箭隊三人組打飛了，大吾很幸運地發現了火之石。
......
【禦龍渡：跑這麼遠就來找火之石......】
大吾對石頭的熱愛無法想象。
【米可利：石頭狂就是這樣的，大吾對石頭很感興趣的，甚至自己的寶可夢基本上都是巖石係的。】
......
小智帶著自己的寶可夢在海邊進行特訓，突然從帳篷旁出現了一個不明物體，搞出了許多幺蛾子出來，後麵發現是龍蝦小兵。
一眼就看上了龍蝦小兵 小智派出木守宮跟它對戰，成功收服了龍蝦小兵。
小剛也在武鬥島鍛煉的時候收服了一隻水躍魚。
不久後，還遇到了小田卷博士，小智一行人就跟小田卷博士研究洞窟得生態，發現了一個人工製造出來的小屋，另外熔巖隊也進入了這個小屋，進入了一個遺跡，海洋隊也在這裏，雙方都在遺跡上做了些檢測就離開。
途中就聽說到了紅色珠子、藍色珠子之類的。
......
【大吾：那倆隊是想用兩個寶石來操控創造海洋和陸地的神獸，一方要擴張大地，一方想要擴張海洋，完全不顧他人是否會陷入危難。】
【禦龍渡：跟火箭隊一樣......】
還好沒成功，不然隨便一方擴張，都會造成很大的破壞。
眾人覺得火箭隊的計劃都比熔巖隊跟海洋隊還要好不少。
.......
白世界——
經過了長時間培養，小遙的甲殼繭進化成了狩獵鳳蝶。
這下小遙是高興了，但武藏很不高興，她的盾甲繭沒有一點進化的跡象，要對盾甲繭展開特訓，甚至還讓小智一行人做陪練，隨後她的盾甲繭進化成了毒粉蛾！
而小智經過了多日的鍛煉，再次向藤樹發起了複仇戰。
新收服的龍蝦小兵展現出了自己的實力，使用蟹鉗錘擊敗了腕力，不過被鐵掌力士的真氣拳給打敗了。
木守宮再次麵對鐵掌力士，這次小智有備而來，找到了幕下力士的弱點。
專門讓木守宮對鐵掌力士的下盤發起攻擊，就讓鐵掌力士站不穩，沒辦法發揮出實力。
最後還真的用這個戰術打法打贏了鐵掌力士，贏得了拳擊徽章。
.......
【馬誌士：哎喲，鐵掌力士的下盤看起來有點疼喔，攻擊下盤的確是不錯的選擇。】
【小勝：管他什麼上盤下盤，能贏才是王道！】